О ПОСТАНОВКЕ ЗАДАЧИ МОДЕЛИРОВАНИЯ МЕЖКЛЕТОЧНОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ В УСЛОВИЯХ QUORUM SENSING

Yuri Sergeevich Nagornov, Nataliya Iosifovna Potaturkina-Nesterova


Аннотация


Цель: постановка задачи для численного моделирования межклеточного взаимодействия микроорганизмов в условиях Quorumsensing. Метод или методология проведения работы: численное моделирование межклеточного взаимодействия на основе метода клеточных автоматов. Результаты:Предложена постановка задачи численного моделирования межклеточного взаимодействия микроорганизмов в биопленке или в условиях Quorumsensing на основе биосоциального подхода. Параметрами модели клетки являются вещества биохимических реакций клеток, а также сигнальные или генетические детерминанты, изменяющие патогенное состояние микробов в процессе их взаимодействия. При этом состояние клетки определяется параметрами только соседних клеток и параметрами среды. Область применения результатов: микробиология, медицина, методы моделирования.

Ключевые слова


БИОПЛЕНКА; МИКРООРГАНИЗМЫ; КЛЕТОЧНЫЙ АВТОМАТ; ЧИСЛЕННОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ В БИОЛОГИИ; ПАРАЛЛЕЛЬНЫЕ РАСЧЕТЫ

Литература


Toffolli T. Cellular Automata as an Alternative to (rather than Approximation of) Differential Equations in Modeling Physics//Physica D.1984. V. 10. P. 117-127.

Григорян Р.Д. Компьютерное моделирование физиологических процессов обеспечения деятельности человека: концепция и перспективы//Пробл. программирования. 2003. №1. С.-57-67.

Молекулярно-генетический анализпатогенности возбудителей воспалительных заболеваний репродуктивного тракта женщин/Потатуркина-Нестерова Н.И.[и др.]. Тольятти: Изд-во ТГУ, 2012. 124 с.

Маянский А.Н. Стафилококковые биопленки: структура, регуляция, отторжение/А.Н. Маянский, И.В. Чеботарь//Журнал микробиология. 2011. № 1. С. 101-108.

Lewis K. Persister cell/K. Lewis//Annu. Rev. Microbiology. 2010. № 64. P. 357-372.

Потатуркина-Нестерова Н.И., Немова И.С., Артамонова М.Н., Орлина М.А., Хромова Е.Б., Хохлова О.Е., Трофимова Н.В., Теплякова О.В. Использование молекулярно-генетических методов в микробиологической диагностике: учебное пособие. Тольятти: ТГУ, 2012. 69 с.

Молекулярно-генетический метод исследования возбудителей рода Enterrobacter: учебно-методическое пособие/Н.И.Потатуркина-Нестерова[и др.]. Тольятти: Изд-во ТГУ, 2012. 32 с.

Ильина Т.С. Биопленки как способ существования бактерий в окружающей среде и организме хозяина: феномен, генетический контроль и системы регуляции их развития/Т.С. Ильина, Ю.М. Романова, А.Л. Гинцбург//Генетика. 2004. Т. 40. № 11. С. 1-12.

Потатуркина-Нестерова Н.И., Немова И.С. Использование ПЦР в диагностике возбудителей воспалительных заболеваний репродуктивного тракта//Современные проблемы науки и образования. 2013. № 2; URL: www.science-education.ru/108-8475 (дата обращения: 04.11.2013).

Потатуркина-Нестерова Н.И., Немова И.С., Артамонова М.Н., Хромова Е.Б., Хохлова О.Е., Трофимова Н.В., Теплякова О.В., Кочергина И.А. Изменение вирулентных свойств урогенитальных энтерококков в условиях межмикробных взаимоотношений//Современные проблемы науки и образования. 2013. № 1; URL: www.science-education.ru/107-7957 (дата обращения: 04.11.2013).




DOI: https://doi.org/10.12731/wsd-2014-2.1-2

Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.




(c) 2016 В мире научных открытий



ISSN 2658-6649 (print)

ISSN 2658-6657 (online)

HotLog Яндекс цитирования